La storia della bioinformatica
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• 1965 - Margaret Dayhoff raccoglie in un atlante gli studi basati sull’analisi delle sequenze proteiche che erano state determinate e pubblicate partendo dalle teorie di Pauling sull’evoluzione molecolare.
• 1970 - Needleman e Wunsch pubblicano l’algoritmo per la ricerca del migliore allineamento globale tra due sequenze.
• 1971 - Gibbs & McIntyre pubblicano un metodo per visualizzare regioni di similarità più o meno stringente basato sulla matrice dot- plot. Questo metodo è stato utilizzato in numerosi algoritmi di analisi comparativa.
• Fine degli anni '70 - Nasce la bioinformatica: in questo periodo vengono pubblicate le prime sequenze nucleotidiche e si inizia ad avvertire l’esigenza di avere a disposizione archivi informatici, consultabili in qualunque momento e contenenti anche l’analisi dei dati di sequenza. L’atlante di Margaret Dayhoff viene convertito in formato elettronica nella banca dati NBRF (National Biomedical Research Foundation).
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1979 - Roger Staden realizza il primo pacchetto per l’analisi dei dati.
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Inizio anni '80 - Il laboratorio EMBL di Heidelberg promuove la
costituzione dalla banca dati di sequenza di DNA e RNA: la EMBL datalibrary.
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1981 - Smith e Watermann pubblicano l’algoritmo per la ricerca del miglior allineamento locale tra due sequenze.
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Dicembre 1981 - Il primo "release" contiene 519 entries relative ad altrettante sequenze nucleotidiche che vengono poi pubblicate e archiviate da Kurt Stueber in un documento elettronico.
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1983 - Wilbur e Lipmann pubblicano un algoritmo per la ricerca di similarità in banche dati.
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Seconda metà degli anni '80 - Vengono realizzate le prime banche dati specializzate come PROSITE, EPD e PDB.
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1985 - Viene pubblicato FASTA, programma utilizzato dai ricercatori biologici.
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1982 – Viene reso pubblico il primo “release” della banca dati GenBank, un archivio prodotto da Walter Goad.
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1986 - Viene realizzata la banca dati Giapponese (DDBJ). Viene stabilita una collaborazione internazionale tra EMBL datalibrary, GenBank e DDBJ.
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1990 - BLAST.FASTA e FASTA sono i due programmi più utilizzati dai ricercatori biologici per la ricerca di similarità fra sequenze.
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2000/2001 - Progetto Genoma Umano: viene completamente sequenziato e assemblato il genoma umano.
